Контрольная 1
1. Альтернативные двухспиральные структуры ДНК. Параметры В-, А- и Z-форм ДНК
2. Репарация ошибок спаривания оснований (mismutc). Роль палиндрома GATC
3. Метод линкеров. Самокомплементарные, адапторные и дополняющие линкеры
Контрольная 2
1. Прерывистость генов эукариот. Экзоны и интроны
2. Инициация трансляции у прокариот. Инициирующие кодоны и сайт связывания рибосом на информационной РНК. Инициаторная тРНК и белковые факторы инициации
1. Альтернативные двухспиральные структуры ДНК. Параметры В-, А- и Z-форм ДНК
Двухспиральная структура ДНК обычно считается од¬ним из неоспоримых фактов молекулярной биологии. Но недавно стало известно, что некоторые параметры классической В-формы необходимо пересмотреть и даже что ДНК способна к образованию других типов двухспиральных структур.
Проблема определения точных значений параметров двойной спирали связана с тем, что все начальные значения получили при изучении дифракции рентгеновских лучей на волокнах ДНК.
2. Репарация ошибок спаривания оснований (mismutc). Роль палиндрома GATC
Репарацией ошибочно спаренных нуклеотидов (mismutc репарация) называют систему обнаружения и репарации вставок, пропусков и ошибочных спариваний нуклеотидов, которые возникают во время процесса репликации и рекомбинации ДНК, а также как результат некоторых типов повреждений ДНК.
3. Метод линкеров. Самокомплементарные, адапторные и дополняющие линкеры
В ситуациях, когда требуется сшить фрагменты, которые были образованы разными эндонуклеазами рестрикции, и имеющими разные, то есть некомплементарные друг другу липкие концы, будут применять так называемые линкеры (или "переходники"). Линкеры - это химически синтезированные олигонуклеотиды, которые представляют собой сайты рестрикции или их комбинацию. Впервые эта идея была предложена Шеллером с сотрудниками в 1977 году.
1. Прерывистость генов эукариот. Экзоны и интроны
Работа Шарпа и Робертса, которая была опубликована в 1977 году, показала, что гены высших организмов обладают «прерывистой» структурой: кодирующие отрезки гена чередуются с не кодирующей ДНК, которая не используется при экспрессии генов. «Прерывистую» структуру гена обнаружили, при гибридизации аденовирусной мРНК с фрагментами одиночной цепи ДНК. Впоследствии также выяснили, что прерывистая структура очень широко распространена у генов эукариот. Им дали название мозаичных, прерывистых генов; генов, которые имеют экзонинтронное строение.
2. Инициация трансляции у прокариот. Инициирующие кодоны и сайт связывания рибосом на информационной РНК. Инициаторная тРНК и белковые факторы инициации
Синтез белка осуществляется на рибонуклеопротеиновом комплексе - рибосоме, в процессе трансляции мРНК. В состав рибосомы входит большая и малая субъединицы, соединяющиеся в области инициации трансляции (translation initiation region - TIR) мРНК во время стадии инициации трансляции. Во время элонгации рибосома будет скользить вдоль мРНК и синтезировать полипептидную цепь. Элонгация будет продолжаться до тех пор, пока рибосома не достигнет стоп-кодона на мРНК - терминация трансляции. После терминации рибосома будет отсоединяться от синтезированного полипептида и сможет вновь повторить цикл трансляции мРНК.
1. Альбертс Б., Брей Д., Льюис Дж. и др. Молекулярная биология клетки в 3-х томах. — М.: Мир, 1994.
2. Докинз Р. Эгоистичный ген. — М.: Мир, 1993.
3. Льюин Б. Гены. — М.: Мир, 1987.
4. Патрушев Л. И. Искусственные генетические системы. — М.: Наука, 2004.
5. Уотсон Дж. Д. Двойная спираль: воспоминания об открытии структуры ДНК. — М.: Мир, 1969.
6. Уотсон Дж. Молекулярная биология гена. - М.: Мир, 1978.
7. Щелкунов С. Н. Генетическая инженерия: Учеб.-справ. пособие. — 2-е изд., испр. и доп. — Новосибирск: Сиб. унив. изд-во, 2004.